Мутация covid-19: что мы знаем о разных штаммах коронавируса?

Помогает ли «Спутник V» от «дельта«-штамма?

«Вакцина «Спутник V» более эффективна против «дельта«-варианта коронавируса, впервые обнаруженного в Индии, чем любая другая вакцина, результаты исследования эффективности которой опубликованы на данный момент, говорится в исследовании Центра Гамалеи, представленном для публикации в международном рецензируемом журнале», – заявили на прошлой неделе разработчики «Спутник V» в официальном аккаунте вакцины в .

Однако насколько «Спутник V» действенен против индийского штамма – неизвестно, так как объективных опубликованных данных на эту тему нет. При этом разработчики «Спутника V» всё же отмечают некоторое снижение эффективности вакцины против новой мутации COVID-19.

ПОВТОРНАЯ ВАКЦИНАЦИЯ

На фоне роста заболеваемости коронавирусом в России Министерство здравоохранения РФ разработало рекомендации по ревакцинации от коронавируса. По словам министра здравоохранения России Михаила Мурашко, для формирования коллективного иммунитета в короткие сроки нужно повторно вакцинироваться не менее чем через полгода и переболевшим, и ранее вакцинированным. В период более спокойной эпидемиологической ситуации, как отмечает министр, ревакцинироваться можно будет раз в год. Однако подобное заявление кажется несколько странным после того, как разработчики того же «Спутника V» в начале этого года говорили о том, что первая российская вакцина защищает от COVID-19 на протяжении двух лет.

– Я не видел каких-то научных и документальных заключений о том, что необходимо повторно прививаться от коронавируса именно в такие сроки, – комментирует «Облгазете» академик РАН, учёный-иммунолог Валерий Черешнев. – Это очень индивидуальный вопрос. Конечно, со временем уровень антител снижается и человек может заболеть коронавирусом снова, но если у него высокий уровень антител, то зачем ему прививаться? Прежде чем повторно ставить вакцину, необходимо делать анализ на количество антител.

Прочтите также:  Состояние полости рта при covid-19

ПОЧЕМУ НЕ БРИТАНСКИЙ?

До появления индийского штамма коронавируса пристальное внимание учёных было приковано к британской версии COVID-19. Британская мутация привела к большому всплеску заболеваемости коронавирусом в Европе и других странах в январе-феврале этого года

В России первый случай этой мутации коронавируса выявили в январе, на Среднем Урале – в апреле. Однако всплеска заболеваемости в нашей стране из-за британского штамма в марте-апреле, как прогнозировали некоторые, не случилось. Александр Соловьёв предполагает, что это может быть связано с тем, что тогда у переболевших COVID-19 уровень антител был выше. Потом же коронавирусных ограничений стало меньше, люди расслабились, а титры антител начали снижаться, что стало прекрасной средой для распространения индийского штамма.

Подготовлено в соответствии с критериями, утверждёнными приказом Департамента информационной политики Свердловской области от 09.01.2018 №1 «Об утверждении критериев отнесения информационных материалов, публикуемых государственными учреждениями Свердловской области, в отношении которых функции и полномочия учредителя осуществляет Департамент информационной политики Свердловской области, к социально значимой информации».

Опубликовано в №110 от 23.06.2021

Стоит ли бояться нового штамма коронавируса?

Если лямбда-вариант показывает такую высокую инфекционность, является ли он более опасным, чем первые штаммы короновируса? На данный момент о новом варианте коронавируса мало что известно, однако считается, что лямбда не представляет существенной угрозы. И доказательств того, что Lambda «превосходит» вариант Delta по своей заразности, пока нет.

Как подчеркивают эксперты, мутации вируса – естественный процесс, и с начала пандемии было известно, что коронавирус будет мутировать. Хотя вирус вне живого организма является мертвой частицей, его эволюционная цель состоит в том, чтобы как можно быстрее добраться от одного организма к другому. 

Все новые варианты вируса подлежат глобальному мониторингу и тестированию, что дает возможность контролировать пандемию коронавируса, проверять эффективность имеющихся вакцин против новых штаммов и подавлять распространение вируса на местном уровне

Какие штаммы коронавируса существуют?

Основных штаммов нового коронавируса семь, они обозначаются буквами GR, G, GH, O, S, L и V. Всё началось со штамма L – именно его обнаружили в китайском Ухане в декабре 2019 года. Однако теперь он постепенно исчезает.

Прочтите также:  Тамифлю или Арбидол – что лучше подействует при коронавирусе

Основные штаммы коронавируса. На графике видно, что штамм L, вышедший из Уханя (оранжевый), постепенно исчезает / Графика с сайта gisaid.org

Остальные штаммы распределены по миру неоднородно: на каждом континенте наиболее распространено, как правило, не более двух основных вариаций. Их распространение можно наблюдать на составленной учёными интерактивной карте Nextstrain, отслеживающей мутации вируса.

Мутация вируса с января 2020 года по регионам / Графика с сайта nextstrain.org

Российский научный центр «Вектор» в октябре сообщил, что выявил более 80 мутаций коронавируса на территории страны. Но широко распространены в основном два штамма: европейский и азиатский, сообщили в «Роспотребнадзоре». При этом последний завезён не из Китая, а из других азиатских стран.

Эти два штамма находят у 99% исследуемых в России, сообщали в ведомстве.

Коронавирус стал опаснее?

У ученых пока нет оснований предполагать, что новый штамм стал смертоноснее. Но доказательства его большей заразности уже есть. Ученые уже опубликовали первоначальную расшифровку вируса, в которой говорится о 17 важных изменениях. Новый вид коронавируса обзавелся новым шиповидным белком. По сути это «ключ», при помощи которого вирус открывает «дверь» клетки в организме человека. Мутация N501Y изменила часть шипа, именуемую как рецептор-связывающий домен (RBD). Именно эта часть самой первой входит в контакт с поверхностью клетки. Ученые из Кембриджского университета (Англия) объявили, что в лабораторных исследованиях это изменение повышает заразность вируса в два раза.

Мутация коронавируса повысила ее заразность

Доктор Эрик Фольц (Erik Volz) из Имперского колледжа Лондона сообщил, что новый штамм коронавируса может быть на 70% заразнее

Но при этом он подчеркнул, что выводы пока делать рано и им важно наблюдать за вирусом. То, что вирус стал заразнее это факт, но насколько именно — пока точно неизвестно

Останутся ли медицинские маски такими же эффективными, или людям придется использовать новые средства защиты, пока неизвестно.

Сохранят ли защитные маски свою эффективность, пока не ясно

Новый штамм коронавируса в России

Эксперты Роспотребнадзора сообщают, что ситуация с появлением нового штамма coronavirus серьезно прорабатывается. По итогам ее рассмотрения будут приняты дальнейшие решения.

Прочтите также:  Роспотребнадзор дал рекомендации по вакцинации для людей от 60 лет

Россию с Англией связывают 20 прямых рейсов в неделю. Летать туда и обратно можно и с пересадками. 22 декабря Россия сообщила о приостановке всех рейсов из Великобритании. По предварительным данным, ограничения будут действовать в течение недели. Информации о том, как именно будут вывозить находящихся в Англии россиян, пока неизвестно.

Глава Роспотребнадзора Анна Попова 10 января сообщила о первом обнаруженном случае нового штамма коронавируса в России. Главный государственный санитарный врач уточнила, что обладатель этой разновидности вируса прибыл из Великобритании, чувствует себя хорошо и симптомов болезни у него нет.

Как вирус мутировал в России?

«Общее число мутаций, которые в совокупности выявлены в секвенированных геномах вируса SARS-CoV-2, составляет многие тысячи, однако только единичные из них зафиксировались и стабильно наследуются», – пояснили в «Роспотребнадзоре». Сейчас насчитывается около 22 таких единичных мутаций, они произошли в январе-марте этого года. Позднее новые штаммы уже широко не распространялись, считают в ведомстве.

В начале эпидемии в России в геноме вируса стабильно зафиксировались три основные группы мутаций, которые сформировали, по данным исследования «Роспотребнадзора», три ветви эволюционного развития. К концу марта 2020 года развитие этих трёх направлений замедляется, и основными циркулирующими в стране стали штаммы с мутацией в гене ORF1b (P314L) и S (D614G).

Эти две мутации стали самым существенным устойчивым изменением в геноме вируса SARS-CoV-2, подчёркивается в исследовании. В «Роспотребнадзоре» считают, что мутация в гене S ассоциируется со снижением патогенности (способности вызывать заболевание, проникая в организм). Ведомство отмечает, что это можно объяснить и улучшением лечения больных в течение пандемии.

Влияние мутации в гене ORF1b (P314L) ещё мало изучено.

Изучением генома коронавируса в России занимаются научные центры «Вектор» и Чумакова. Эти же центры недавно разработали две потенциальные вакцины / Фото Kirill Kukhmart / Tass

«Вирусы мутируют постоянно, однако коронавирусы мутируют значительно медленнее по сравнению с другими РНК-вирусами», – рассказывает Любовь Козловская, заведующая лабораторией полиомиелита и других энтеровирусных инфекций федерального научного центра исследований и разработки иммунобиологических препаратов имени Чумакова.

Штамм S (D614G) сейчас является объектом пристального внимания учёных. Его впервые выявили в Индонезии в августе; тогда сообщалось, что этот штамм якобы в 10 раз более заразен, чем первоначальный штамм вируса.

Некоторые исследования, которые пока находятся на стадии препринта (то есть не отрецензированы и не опубликованы в научных изданиях), приходят к выводу, что у этой мутации действительно может быть более высокая инфицирующая способность, а вирусная нагрузка при инфицировании этим штаммом – более высокой. Но окончательных выводов по этому поводу нет.

Первые варианты вируса с распространёнными в России двумя мутациями выявлены в конце января в Китае, затем – в Австралии. В феврале эти варианты обнаружили в большинстве стран Западной Европы, Саудовской Аравии, США, Канаде, Мексике, Бразилии, Марокко и Сенегале.

Детальное сравнение геномов вируса на территории России и зарубежных стран говорит о том, что в стране циркулируют штаммы, завезённые из Западной Европы. Их завезли в марте и апреле 2020 года, отмечают в «Роспотребнадзоре».

» в течение этих девяти месяцев мутировал очень мало и не изменялся в тех его локусах, которые отвечают за проявления эпидпроцесса, за его, так скажем, агрессивность и злость», – заявила на прошлой неделе глава «Роспотребнадзора» Анна Попова. В ведомстве считают, что у вируса низкая способность к мутациям, он накапливает лишь около двух точечных замен в месяц, то есть за год может произойти около 24 мутаций.

В «Роспотребнадзоре» в ответ на запрос «Би-би-си» сообщили, что ежемесячно учёные ФБУН ГНЦ ВБ «Вектор» расшифровывают полностью более 150 геномов нового коронавируса. «Получаемые данные используются для анализа актуальности используемых диагностических тест-систем, помогают выявлять завозные случаи, оценивать региональные особенности генетического разнообразия SARS-CoV-2», – заявили в ведомстве.

Сейчас проводится секвенирование геномов вирусов и накопление данных в различных лабораториях по всему миру, в том числе и в центре Чумакова, рассказывает Козловская. Учёные, по её словам, проведут корреляции геномов вирусов с клинической картиной пациентов, от которых они выделены, что даст возможность пролить свет на значение наиболее распространённых мутаций.

Изучить влияние каждой конкретной мутации на клиническую картину заболевания Covid-19 сложно, признаёт она. Учёным предстоит изучить значение каждой конкретной мутации для структуры мутантных белков, а также определить роль этих мутаций в развитии клинических симптомов и поражения лёгких в экспериментах на животных.

В «Векторе» не ответили на вопросы «Би-би-си» относительно процесса изучения штаммов коронавируса. Там, как и в ФНЦИРИП имени Чумакова, на данный момент разработали и анонсировали новые вакцины от SARS-CoV-2, которые ждут клинических исследований.

Мутации и штаммы: в чем различия?

Мир противостоит пандемии ковида более полутора лет. В арсенале врачей немало препаратов для борьбы с болезнью, разработаны методики и протоколы лечения. Но и возбудитель недуга развивается, меняет свойства и адаптируется к новым условиям. Появляются новые штаммы вируса.

По словам руководителя вирусологического центра «Вектор» Рината Максютова, сегодня ученым известно порядка 16 тысяч мутаций коронавирусной инфекции. В большинстве своем они не слишком различаются. Незначительные мутации дают экспертам материал для изучения, но не оказывают особого влияния на ход пандемии.

Гораздо важнее получить информацию о штаммах вируса — его агрессивных версиях, которые в ряде случаев ведут ко многим летальным исходам.

Защищают ли вакцины от Lambda COVID?

Текущие исследования не указывают на то, что вариант Lambda устойчив к вакцинам. Однако есть подозрение, что из-за большого количества мутаций в геноме он может быть более устойчивым к современным вакцинам, чем оригинальный тип коронавируса.

Но у привитых людей не должно быть причин для беспокойства. В случае заражения новым штаммом, в большинстве случаев привитые и ранее болевшие пациенты заболевают незначительно или бессимптомно. Однако больные могут передавать вирус окружающим, что в случае отсутствия вакцинации может привести к летальному исходу

Поэтому важно вакцинировать как можно больше людей, чтобы не только замедлить мутацию вируса, но и его распространение

Исследователи из Медицинской школы Гроссмана Нью-Йоркского университета провели исследование влияния Lambda на вакцинированных Pfizer и Moderna, и хотя наблюдалось снижение нейтрализующих антител, вакцины обеспечивают удовлетворительную защиту от Lambda и других ранее, идентифицированных вариантов коронавируса.

Более того, относительно низкая изменчивость вируса SARS-CoV-2 по сравнению с другими РНК-вирусами говорит в пользу вакцин. Коронавирус имеет генетический материал в виде одной молекулы, и в процессе репликации демонстрирует не так много ошибок, лежащих в основе мутации.

О чем следует помнить

Ученые из разных стран пришли к единому выводу. В первую очередь, по их мнению, нужно поторопиться с вакцинацией. Чем меньше коронавирус передается от одного к другому, тем меньше у него шансов мутировать. Это означает, что ситуация с его мутациями будет взята под контроль.

Одновременно ученые отмечают скорость распространения “британского штамма”. По их мнению, меры защиты власти России и других стран СНГ должны принимать уже сейчас. По всему миру прекращается авиасообщение с Великобританией. Некоторые страны закрывают и автомобильное сообщение с этим государством. Люди, которые приезжают из Англии, обязательно помещаются на 14-дневный карантин. Но риск проникновение нового штамма на территорию РФ и других стран СНГ все-таки есть.

Будут ли эффективны вакцины, если вирус мутирует?

Известно, что коронавирус мутирует медленнее, чем вирус гриппа: по разным оценкам, в два раза медленнее или на треть. В связи с этим вакцина от коронавируса «вероятно, будет стабильной и эффективной дольше, чем вакцина против гриппа», – говорит в беседе с HuffPost почётный доцент и клинический вирусолог университета Лестера Джулиан Танг.

При этом пока неизвестно, как долго будет сохраняться приобретённый с помощью вакцины иммунитет, даже если она будет работать как следует, напоминает учёный. Эффективность вакцины может зависеть и от индивидуальных особенностей организма, так же, как и у вакцины против гриппа, говорит Танг.

Пока что учёные считают, что вакцины, разрабатываемые во всём мире для борьбы с первыми штаммами нового коронавируса, будут столь же эффективны и в отношении новых мутаций. Исследование австралийских и американских учёных, которое проводили с помощью компьютерного моделирования и опытов на хорьках, 8 октября опубликовал научный журнал NPJ Vaccines. Животным вводили потенциальную вакцину INO-4800, разработанную американской компанией Inovio Pharmaceuticals.

Большинство вакцин, разрабатываемых во всём мире, были смоделированы на основе исходного D-штамма вируса, который был более распространён среди последовательностей, опубликованных в начале пандемии, пояснили учёные.

С тех пор вирус мутировал в штамм G, вариации которого сейчас являются доминирующими по всему миру. У исследователей были опасения, что эта мутация негативно отразится на эффективности разрабатываемых вакцин.

Пока учёные склоняются к тому, что кандидаты на вакцину будут эффективны для любых штаммов коронавируса / Фото AFK Sistema

«Несмотря на мутацию D614G в шиповидном белке, мы подтвердили экспериментами и моделированием, что вакцины-кандидаты по-прежнему эффективны», – заявил один из авторов исследования, профессор Йоркского университета Сешадри Васан.

По словам учёного, обнаружилось, что наиболее часто встречающийся штамм G вряд ли потребует частого подбора новых вакцин, в отличие от гриппа, вакцину от циркулирующих штаммов которого разрабатывают каждый год.

Так как отличия штаммов, циркулирующих в России, минимальны они, скорее всего, не оказывают значительного влияния на структуру вирусных белков, говорит Любовь Козловская из центра имени Чумакова. Это, по её словам, делает возможным создание и применение вакцины от Covid-19, которую не придётся переделывать каждый год.

Не стоит забывать, что ни одна из разработок вакцин в мире пока не прошла третью фазу клинических исследований, в которых делается вывод о её эффективности.

В России эту стадию сейчас проходит вакцина центра имени Гамалеи «Спутник V». Две другие российские вакцины лишь готовятся к прохождению этой стадии.

Только после этих исследований, в которых примут участие десятки тысяч человек, можно будет делать выводы по поводу стойкости сформированного вакцинами иммунитета к коронавирусу.

Сверхзаразность

Главное отличие варианта B.1.617.2 — так называется дельта-штамм в филогенетической классификации разновидностей коронавируса — его невероятная заразность. 

По оценкам ученых из Великобритании, куда дельта пришел раньше остальных европейских стран (и где, в отличие от континентальной Европы, очень бодро сняли существенную часть ковидных ограничений), «индиец» заражает людей на 60% лучше предыдущего рекордсмена, альфа-штамма, который, в свою очередь, был на 50% заразнее других версий SARS-CoV-2. 

По предварительным оценкам, заразность дельта-штамма сравнима с заразностью ветрянки.

Ирина Якутенко

У ранних версий этот параметр находился на уровне обычных простуд или полиомиелита. Благодаря выдающимся способностям заражать людей, дельта-штамм вытесняет все конкурирующие варианты с тех территорий, куда приходит. В том числе, В.1.617.2 вытеснил некоторые разновидности коронавируса, которые умели уходить от иммунитета лучше него.

Как минимум одна из причин повышенной трансмиссивности — огромное количество вирусных частиц в верхних дыхательных путях заболевших, откуда они с капельками жидкости переносятся на слизистые находящихся поблизости людей. Китайские исследователи определили, что в носоглотке человека, подхватившего дельту, обнаруживается в 1000 раз больше вирусных частиц, чем у тех, кто заразился каким-нибудь другим вариантом. 

Более того, ПЦР-тест находит вирусную РНК у инфицированных дельтой, в среднем, на четвертый день после контакта с больным. Среднее время первого положительного теста после контакта с носителями других вариантов SARS-CoV-2 составляло шесть дней.

Китайские ученые определили среднее время от заражения до проявления симптомов, то есть инкубационный период для дельта-штамма. Оно составило 4,4 дня против 5,2 во время первой вспышки в Ухане. Время, за которое один инфицированный заражает следующего, составило пугающие 2,9 дня — в начале 2020 года с исходным вариантом коронавируса оно колебалось около 5,7 дня.

Какие симптомы?

Из-за того, что индийский штамм быстрее передаётся от одного человека к другому, время инкубационного периода болезни сейчас также сократилось. Если ещё несколько месяцев назад человек становился опасным для окружающих примерно через семь дней после заражения, то сейчас уже через двое-трое суток. Первые признаки заболевания штаммом «дельта» проявляются на четвёртые-пятые сутки и, как уверяют врачи из разных стран, симптоматика изменилась.

Так, индийскому штамму COVID-19 более свойственны проявления со стороны желудочно-кишечного тракта: боли в животе, потеря аппетита, рвота, тошнота, а также боль в суставах, потеря слуха. Как заявила РИА Новости заместитель директора по клинико-аналитической работе Центрального НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора Наталья Пшеничная, «по свидетельствам индийских врачей, по сравнению с началом пандемии, у пациентов стали чаще встречаться диарея и микротромбозы нижних конечностей, которые могут привести к развитию гангрены и ампутации пальцев». По мнению московских медиков, которые сейчас принимают сотни новых пациентов, люди стали тяжелее болеть, из-за чего растёт число госпитализаций. При этом появляются пациенты, которые не реагируют на стандартные схемы лечения осложнений COVID-19.

– Потеря обоняния и лихорадка больше не являются типичными признаками коронавируса, – считает Александр Соловьёв. – В первую пятёрку симптомов заражения индийским штаммом входят головная боль, насморк, заложенность носа, боль в горле, кашель. Всё это относится и к симптоматике простуды, поэтому люди, не зная, что это может быть коронавирус, продолжают контактировать с другими людьми, заражая окружающих, и упускают момент ухудшения ситуации. При «дельта«-штамме осложнения появляются быстрее.

Оцените статью