Как мы сами помогаем вирусу
Инфекционистам очевидно, что иммунитет, выработанный с помощью прививок от уханьского штамма, стал хуже работать. Но это, как ни странно, не самый главный фактор
Важной причиной нового витка эпидемии стало поведение людей: за полтора года мы все устали от этой болезни и расслабились. Носим маски на подбородке, посещаем массовые мероприятия и не соблюдаем дистанцию
«Когда появился уханьский вирус, мы все стали единым блоком по предотвращению распространения этой инфекции, — рассказывает каналу «Наука» Георгий Сапронов, главный внештатный инфекционист Управления делами президента РФ. — Мы и носили маски, и соблюдали дистанцию, и находились на самоизоляции. Когда пришла «Дельта», к сожалению, мы перестали осуществлять противоэпидемические действия, которые должны были бы продолжать… Люди стали ходить в рестораны, на концерты, общаться без маски и т. д. Поэтому распространение этой инфекции, конечно же, стало гораздо больше. По разным причинам «Дельта» стала более контагиозной, то есть более заразной».
Последние дни статистика выглядит откровенно пугающей. Более тысячи россиян умирают в день от коронавируса. Неужели «Дельта» более летальный штамм или дело в чем-то другом? «Тяжесть симптомов у пациента зависит от дозы вируса, который человек получил, — объясняет к. б. н. Александр Панчин, старший научный сотрудник Института проблем передачи информации. — Повышенная вирусная нагрузка и есть причина увеличения летальности. Коронавирус SARS-CoV-2 адаптировался к тому, чтобы человек имел повышенную вирусную нагрузку и больше вирусных частиц выдыхал. Соответственно, больше вирусных частиц вдыхает другой. Для варианта «Дельта» люди получают большую дозировку этого вируса». Другими словами: хотите снизить вирусную нагрузку? Носите маски.
Фото: Nekrasov Eugene / Shutterstock.com
А как же, спрашивается, вакцина? Она что, больше не работает? Работает, говорят инфекционисты, но это не значит, что вы не заболеете в легкой форме и не станете переносчиком. «К удивлению вирусологов, мутации оказались значимы, и это главная новость, — говорит к. б. н. Дмитрий Кулиш, профессор Сколковского института науки и технологии. — Вторая главная новость — большинство мировых вакцин продолжает нейтрализовать даже агрессивные мутанты достаточно хорошо… Большинство провакцинированных людей продолжают быть защищены, но сейчас они защищены уже не от инфекции, а от тяжелого течения». В прошлом году клинические исследования всех вакцин показали полную защиту от тяжелого течения болезни и 90-процентную защиту от инфекции. «Сейчас, с новыми вариантами, мы признаем: стало слабее. Защита от тяжелого течения сейчас около 90%. И 70–80% — защита от инфекции», — отмечает Дмитрий Кулиш.
Заражение привитых
Уникальные способности дельта-штамма не могли не сказаться на его взаимоотношениях с вакцинами. Так называемые real life data, то есть данные о том, как вакцина работает при реальном массовом применении, а не в ходе клинических испытаний, указывают, что B.1.617.2 способен заражать привитых намного чаще, чем предыдущие штаммы. Это, очевидно, происходит из-за того, что часть выработанных у них антител перестают «видеть» измененный спайк-белок дельта-штамма. В результате при вторжении вируса имеющейся защиты оказывается недостаточно для того, чтобы сразу подавить размножение вирусных частиц.
Особенно ярко снижение вакцинной защиты проявилось в Израиле, где на фоне распространения дельты эффективность мРНК-вакцины от Pfizer/BioNTech упала с 95% до 64%.
Эффективность прививки в отношении тяжелого течения и госпитализации изменилась не так значительно: с 97,5% до 93%.
В других странах снижение оказалось не столь драматичным: в Англии две дозы вакцины от Pfizer/BioNTech защищали от заражения дельта-штаммом с эффективностью 87,9% против 93,4% защиты против альфы. Векторная вакцина от AstraZeneca справлялась с B.1.617.2 еще хуже: ее эффективность против заражения после второй дозы составила 66,1% против альфа-штамма и 59,8% против дельта. В Канаде полный курс мРНК-вакцин давал 89% защиты против альфа-штамма и 87% против дельта.
Существенная разница в показателях защиты в разных странах может объясняться социальными причинами. В Израиле, который в начале года прививал жителей быстрее других стран, очень рано сняли практически все ковидные ограничения. Люди начали активно общаться друг с другом, что неизбежно способствовало широкому распространению вируса, причем, благодаря повышенной заразности, он начал расползаться куда быстрее предыдущих вариантов. В результате шансы на встречу с SARS-CoV-2 резко выросли как для привитых, так и для непривитых, а значит, возможностей для «пробоя» вакцинного иммунитета у «индийца» оказалось намного больше, чем, скажем, в Канаде, где сохраняются многие ограничения.
Осторожные хорошие новости. Хотя в первые дни активной фазы размножения вируса в носоглотке заразившихся привитых синтезируется столько же вируса, сколько у непривитых, количество патогена в верхних дыхательных путях тех, кто получил полный курс вакцинации, уменьшается заметно быстрее, чем у неиммунизированных. Так, на восьмой день болезни у привитых РНК дельта-штамма обнаруживалась на 27-28-м цикле ПЦР, у непривитых — на 21-23-м цикле. Грубо, отличие в один цикл соответствует трехкратной разнице в концентрации вируса.
Иными словами, хотя в активной фазе размножения вируса привитые выделяют столько же частиц, сколько и непривитые, период, когда они могут заразить других людей, намного короче.
Заболевшие привитые очень редко попадают в больницу и совсем уж нечасто умирают, причем чаще всего печальный итог случается у пациентов с большим количеством сопутствующих заболеваний.
Во-первых, у таких инфицированных все же имеется достаточно много рабочих антител, которые не дают вирусу размножаться слишком быстро, во-вторых, в ходе болезни иммунная система налаживает выпуск более специфичных антител.
Защищают ли современные вакцины от варианта Delta?
Имеющиеся в настоящее время вакцины, несмотря на постоянно возникающие новые варианты вируса SARS-CoV-2, показывают довольно высокую эффективность – они защищают не только от тяжелого течения болезни, но и летального исхода в результате заражения.
Однако по-прежнему существует опасение, что со временем появится новый штамм, полностью устойчивый к имеющимся в настоящее время препаратам. По этой причине каждый новый вариант мутации контролируется, эффективность вакцин тщательно проверяется в клинических испытаниях и во многих странах рассматривается следующая доза препарата.
Сверхзаразность
Главное отличие варианта B.1.617.2 — так называется дельта-штамм в филогенетической классификации разновидностей коронавируса — его невероятная заразность.
По оценкам ученых из Великобритании, куда дельта пришел раньше остальных европейских стран (и где, в отличие от континентальной Европы, очень бодро сняли существенную часть ковидных ограничений), «индиец» заражает людей на 60% лучше предыдущего рекордсмена, альфа-штамма, который, в свою очередь, был на 50% заразнее других версий SARS-CoV-2.
По предварительным оценкам, заразность дельта-штамма сравнима с заразностью ветрянки.
Ирина Якутенко
У ранних версий этот параметр находился на уровне обычных простуд или полиомиелита. Благодаря выдающимся способностям заражать людей, дельта-штамм вытесняет все конкурирующие варианты с тех территорий, куда приходит. В том числе, В.1.617.2 вытеснил некоторые разновидности коронавируса, которые умели уходить от иммунитета лучше него.
Как минимум одна из причин повышенной трансмиссивности — огромное количество вирусных частиц в верхних дыхательных путях заболевших, откуда они с капельками жидкости переносятся на слизистые находящихся поблизости людей. Китайские исследователи определили, что в носоглотке человека, подхватившего дельту, обнаруживается в 1000 раз больше вирусных частиц, чем у тех, кто заразился каким-нибудь другим вариантом.
Более того, ПЦР-тест находит вирусную РНК у инфицированных дельтой, в среднем, на четвертый день после контакта с больным. Среднее время первого положительного теста после контакта с носителями других вариантов SARS-CoV-2 составляло шесть дней.
Китайские ученые определили среднее время от заражения до проявления симптомов, то есть инкубационный период для дельта-штамма. Оно составило 4,4 дня против 5,2 во время первой вспышки в Ухане. Время, за которое один инфицированный заражает следующего, составило пугающие 2,9 дня — в начале 2020 года с исходным вариантом коронавируса оно колебалось около 5,7 дня.
Корона Дельта и вакцинация Johnson & Johnson
Люди, получившие вакцину Johnson&Johnson, также защищены от дельта-варианта коронавируса. Компания объявила данные, показывающие, что вакцина Janssen генерирует сильную и долгосрочную активность иммунной системы против варианта Delta и других новых вариантов коронавируса.
Исследования также показывают, что вакцина Johnson&Johnson более эффективна против варианта Delta, чем предыдущий наблюдаемый бета-вариант. Вакцина Janssen нейтрализует штамм Delta в течение 29 дней после первой дозы, а иммунитет к коронавирусу в варианте Delta составляет не менее восьми месяцев. Более того, эта защита со временем увеличивается, поэтому у людей, привитых этим препаратом, нет причин беспокоиться.
Сценарии вирусологов не сбылись
Когда-то нас пугали британским штаммом вируса. Тогда Россия успела быстро среагировать: перекрыла авиационное сообщение с Великобританией, и штамм не распространился по территории нашей страны. А в случае с индийским генотипом SARS-CoV-2 мы не были столь осторожны. До последнего продолжали летать самолеты, велись торговые отношения, происходил обмен туристами. В итоге наблюдаем новую волну эпидемии, из-за которой теперь вводится локдаун: с 28 октября по 7 ноября.
Вирусологи в растерянности. Со временем, по всем прогнозам, болезнь должна становиться «все менее актуальной». Но мы видим другое: поднимается новая волна эпидемии. Год назад многие специалисты заявляли в интервью каналу «Наука», что по законам эпидемиологии, когда инфекция распространяется и мутирует, она становится более заразной, но ослабевает. Этому есть простое эволюционное объяснение: паразиту невыгодно уничтожать хозяина, ему выгодно распространяться.
За последнее время мы обнаружили, что коронавирус, вызывающий COVID-19, ведет себя совершенно иначе. Британский штамм оказался более опасным, чем уханьский. Сравним с ним и южноафриканский штамм. А индийский штамм «Дельта», захвативший Россию к сентябрю 2021 года, более заразен и опасен, у него сокращен инкубационный период и он не щадит молодежь. Выходит, коронавирус SARS-CoV-2 начал развиваться вопреки законам эволюции?
Есть ли вакцина от Дельта-коронавируса?
Вакцина, на 100% действующая против индийского варианта коронавируса, пока не создана, но исследования новых препаратов ведутся сразу в нескольких странах.
Например, в августе начала клинические испытания третьей, бустерной дозы вакцины, которая, согласно опубликованным отчетам, должна обеспечить высокую защиту от штамма Delta, фармкомпания Pfizer. Производитель вакцины заявляет, что третья доза дает до пяти раз более высокий уровень антител, чем вторая прививка, и не вызывает многих побочных эффектов.
Управление по санитарному надзору за безопасностью пищевых продуктов и медикаментов США (FDA) одобрило использование третьей дозы вакцины Pfizer в чрезвычайных ситуациях, в т. ч. для людей с ослабленным иммунитетом. Ожидается, что третья доза будет доступна всем американцам с конца сентября.
Из-за опасений дальнейших волн инфекций, также ввели или рассматривают возможность вакцинации третьей дозой Израиль, Германия и Великобритания. Третью прививку можно делать людям с ослабленным иммунитетом, в т.ч. диализным, ВИЧ-инфицированным, получающим активное противоопухолевое лечение и с умеренными или тяжелыми первичными иммунодефицитами.
Мировые новости
Генетик Прусс рассказал, сможет ли дельта-штамм превратиться в супермутанта
Подробнее…
Российский фондовый рынок получил новое дыхание
Инвесторы опять начали обращать внимание на российский фондовый рынок. Спустя три месяца после технического перерыва, сумма вложений составила около 51 миллиона долларов
Конечно, совокупность рискованных операций с использованием больших ресурсов остается довольно низкой, однако в целом, по сравнению с прошлым годом, тренд не вызывает опасений.
Хотя процент рискованных операций остае…
Подробнее…
«Их разыскивает Интерпол»
Интерпол отправил полицейским отделениям на почтовый ящик и опубликовал международное объявление «Разыскивается». Разыскивается французский гангстер, который, используя взрывное устройство, сбежал из тюрьмы в Лилле, Франция, на прошлых выходных.
Редион Фаид взял на мушку пять человек, в том числе четырех охранников, в тюрьме в прошедшую субботу. Затем он проложил себе дорогу к с…
Подробнее…
Покупки стройматериалов через Интернет: ожидания и результат
Наиболее активно в интернете покупают промышленное оборудование.
Рынок электронных покупок активно растет: российские предприятия и бизнесмены все чаще проводят покупки через интернет. Аналитический центр новостного портала проанализировал, какие именно товары чаще всего приобретали российские потребители на электронных торгах в прошлом году.
Почти половина (47,4%) торгов, проведенны…
Подробнее…
Казус с композитором
Раймонд Паулс вляпался в очень некрасивую историю. Его композицию «Санкт-Петербург», которую исполняла певица Азиза, внезапно исполнила Лайма Вайкуле — с совершенно другим текстом.
Азиза поделилась, что давно мечтала исполнить композицию авторства легендарного тандема Паулс — Резник. Она исполняет ее уже несколько месяцев. Обнаружив ту же мелодию в исполнении знаменитой певицы Лаймы Вайкуле…
Подробнее…
Лукашенко отдает многомиллиардный проект Китаю
Белоруссия уже готова отдать Китаю строительство нового бизнес-центра «Минск-Сити». Напомним, что реализацией данного проекта занимается российская нефтегазовая фирма «Итера». Президент Белоруссии Александр Лукашенко рассказал китайским средствам массовой информации в своем интервью об этом и многом другом в преддверии двадцатилетия установления отношений между Китаем и Белоруссией.
«Мы сами …
Подробнее…
Больше новостей
В чем разница между вариантами Дельта и Альфа?
Разница между штаммами огромна:
- Большая вирулентность варианта Дельта по сравнению со штаммом Альфа. Индийский штамм на 40-60% более заразен. В случае Альфа один больной в среднем заражает 3 человека, при индийском варианте – около 7 человек. Вариант Дельта, в силу высокой инфекционности, — наиболее опасен для непривитых и привитых только одной дозой. Также он передается вакцинированным против COVID-19. Однако отчет Центров по контролю и профилактике заболеваний оптимистичен – только 0,01% полностью привитых людей заражаются этим вариантом коронавируса, а шансы на то, что полностью привитый человек отправится в больницу в результате дельта-инфекции, снижаются на 94%.
- Заражение дельта связано с удвоенным риском тяжелого течения заболевания и госпитализации у непривитых людей. Это демонстрируется в т. ч. отчетом Центра по контролю и профилактике заболеваний в Атланте и наблюдениями в Сингапуре, показывающими, что людям, инфицированным вариантом Delta, чаще требуется кислородная терапия.
- Большее количество вирусных частиц. Исследование, проведенное в Южной Корее, указывает на то, что инфицированные вариантом Delta, имеют в организме в момент появления первых симптомов заболевания до 300 раз больше вирусных частиц, чем инфицированные оригинальным штаммом коронавируса. Со временем количество частиц коронавируса уменьшается и примерно на 10-й день после появления симптомов находится на том же уровне, что и в остальных случаях.
- Опасность для детей и молодых людей. Штамм Дельта, в отличие от более ранних вариантов, все больше поражает детей и молодежь.
- Симптомы коронавируса Дельта. В свете текущих данных, симптомы инфекции Delta не отличаются от симптомов, вызванных другими штаммами коронавируса. Но такие признаки, как потеря вкуса и обоняния, считавшиеся важными в первые месяцы пандемии, диагностируются гораздо реже. Наиболее характерны – кашель, лихорадка и одышка, тошнота, боль в животе и рвота.
Коронавирусную вакцину будут вводить подросткам
Что делать
Решение — ускорение вакцинации и повсеместное использование масок, особенно в помещениях, избегание массовых сборищ и прочие ограничительные меры до момента, пока существенный процент населения не приобретет иммунитет к коронавирусу.
Американские Центры по контролю и профилактике заболеваемости (CDC) — аналог российского Роспотребнадзора, но с куда более широкими полномочиями — 27 июля изменили рекомендации по ношению масок. Если в мае CDC обрадовали полностью привитых тем, что теперь им не нужно надевать маски в помещении, то в новой версии рекомендаций написано, что даже получившим полный курс иммунизации следует это делать, особенно если они живут в районах, где эпидемиологическая ситуация неблагополучна.
Хотя привитые заражаются дельта-штаммом по-прежнему очень редко — в США на конец июля было зарегистрировано около 65 тысяч таких прорывных инфекций на 160 миллионов привитых, то есть их частота составляет 0,04% — и совсем в исключительных случаях болезнь у них проходит тяжело, они могут заражать непривитых. И, что хуже, в их организмах могут формироваться новые штаммы коронавируса, устойчивые к тем антителам, которые пока еще защищают нас от вируса.
Согласно выводам новой работы, сделанной группой эволюционных биологов под руководством Федора Кондрашова, чем больше привитых будет в обществе — при сохранении высокой доли неиммунных — тем выше вероятность такого сценария. Грубо говоря, в таких условиях вирусу будет все труднее отыскивать себе новых жертв, и преимущество получат те его разновидности, которые, в силу случайных изменений, приобретут мутации, делающие их устойчивыми хотя бы к части антител.
Критическим порогом, близким к достижению коллективного иммунитета, когда влияние такого отбора будет особенно значительным, авторы назвали долю в 60% привитых — однако эта оценка относится к менее заразным предшественникам дельта-штамма.
Как объясняет Кондрашов, преобладание в популяции сверхзаразного B.1.617.2 сдвинет порог ухода от антител до цифры 90%.
90% — именно столько людей должны иметь иммунитет, чтобы распространение дельты в популяции прекратилось.
Кажется, что это менее опасная ситуация, но в действительности ничто не мешает устойчивому штамму сформироваться и раньше — несколько таких штаммов уже образовывалось в разных частях света, однако позже все они были вытеснены дельтой.
Кроме того, в ситуации господства B.1.617.2 новый уходящий от антител штамм, вероятнее всего, сформируется именно на его основе, а это означает, что он будет сочетать в себе два крайне неприятных для людей качества: способность ускользать от иммунитета и быстро распространяться.
В Китае благодаря относительно небольшому числу заболевших и сверхтщательным и очень масштабным мерам по выявлению всех инфицированных медицинские власти находят всех, кто был заражен в каждом инфекционном кластере.
Дельта-вариант и вакцинация Moderna
В конце июня этого года Moderna опубликовала результаты исследований, подтверждающие эффективность препарата против коронавируса Delta. Эта вакцина производит нейтрализующие титры не только для Delta, но и для всех других современных штаммов.
В отчетах, опубликованных на medRxiv, указано, что эффективность вакцины против заражения штаммом дельта составляет 76%. Т. е. вакцина по-прежнему эффективна в предотвращении госпитализации из-за COVID-19. Исследования по эффекту этого препарата продолжаются.
Начались новые испытания новой вакцины от коронавируса Спутник Лайт
Картина болезни
Дельта-штамм не только «ускоряет» болезнь, но и влияет на ее тяжесть. Наверняка утверждать это пока нельзя, но данные сразу из нескольких стран указывают, что его отличает не только рекордная заразность, но и повышенная патогенность.
Людям, подхватившим B.1.617.2 в Канаде и Шотландии, чаще требовалась врачебная помощь, чем тем, кто заболевал ковидом во времена доминирования других вирусных вариантов. В Сингапуре госпитализированным с дельта-штаммом с большей вероятностью требовалась кислородная поддержка, а их шансы попасть в реанимацию и умереть были выше, чем у тех, кого привозили в больницу с альфа- или бета-штаммами.
Кроме того, есть отдельные свидетельства в пользу того, что заболевание, вызванное дельта-штаммом, развивается быстрее.
Если раньше у пациентов, которым приходилось ехать в больницу, ухудшение начиналось спустя примерно неделю после начала симптомов, теперь это время часто сокращается до нескольких дней.
Еще одна неприятная черта нынешней дельта-эпидемии — существенно больший процент молодых среди госпитализированных. Если в конце января больше половины тех, кто попадал с ковидом в больницу в США, составляли люди старше 65 лет, то сейчас эта категория дает только четверть всех госпитализированных.
Сейчас 41% пациентов — люди от 18 до 49 лет.
В январе их было всего 22%. Связана ли эта диспропорция с тем, что в США и Европе среди нестарых людей заметно выше доля непривитых, или с особой любовью B.1.617.2 именно к молодым — пока неясно.
Изменились и ранние симптомы ковида. У людей все чаще не пропадает обоняние.
Если в предыдущих версиях самыми характерными признаками были кашель, температура и потеря обоняния, то подхватившие дельта-вариант обычно жалуются на головную боль, боль в горле, температуру и насморк. Эти симптомы куда больше похожи на проявления обычной простуды, поэтому нередко заболевшие продолжают ходить на работу и встречаться с друзьями, полагая, что подхватили какой-то неопасный вирус.
Исчезновение из списка частых симптомов потери обоняния испортило жизнь не только коллегам заболевших — исследователи, занимающиеся сбором «народной» статистики запросов в интернете для предсказания динамики эпидемии, с приходом дельта-штамма лишились одного из самых надежных инструментов, запроса «пропало обоняние». Теперь для оценки того, как изменяется заболеваемость, им приходится полагаться на менее высокоточные запросы вроде «скорая не едет».
Вирус остается жить внутри
Страшной особенностью этого коронавируса является то, что нет никакой гарантии, что после исчезновения всех симптомов болезни он покинет ваш организм. «Вирус заходит в человеческое тело и мгновенно начинает приспосабливаться и мутировать, — рассказывает каналу «Наука» Дмитрий Кулиш. — И находит себе орган или ткань, где он с помощью легких точечных мутаций становится самым мощным. То есть это совершенно понятный для человека механизм. Самые страшные вирусы — вирус СПИДа, герпеса, гепатита B, гепатита C. Они все страшны своей персистенцией — они где-то живут у нас в организме и вылезают в самый неподходящий момент».
Самые страшные поражения, которые наносят человеку вирусы, — это поражение печени при гепатите и поражение мозга при вирусе энцефалита. «Мы все с ужасом думали: будет персистировать SARS-CoV-2 или нет? — рассказывает каналу «Наука» Дмитрий Кулиш. — И, к сожалению, сейчас появляются публикации, что да, он персистирует. Неделю назад в самом уважаемом журнале Nature вышла сильнейшая публикация, которая четко доказывает, что чуть ли не у 30% пациентов вирус SARS-CoV-2 живет в эпителии желудка. То есть, даже когда у человека закончилась температура, кашель и пневмония, вирус продолжает жить в эпителии желудка. Безусловно, он там живет с какими-то слабенькими мутациями, но он там живет. И у некоторых пациентов он выходит ».
Кулиш рассказал «Науке» о страшной публикации, которая вышла несколько месяцев назад и показалась многим людям фильмом ужасов. «Сейчас она начинает приобретать уже реальные масштабы, — говорит он. — Ученые проследили развитие длинного ковида в мышах и продемонстрировали последствия. Мы берем мышь, специально генетически модифицированную под рецепторы, которые могут заражаться COVID-19 — вирусом SARS-CoV-2. Сначала у нее начинается пневмония, все как положено. Потом все мыши от этой пневмонии выздоравливают, начинают радостно бегать по клеткам. Но выясняется, что вирус уже к ним залез в мозг, у них начинается тяжелейший энцефалит, эпилепсия, потеря зрения и смерть в страшных мучениях — девяти мышей из десяти. И только одна выживает».
Эта недавно открытая особенность коронавируса позволяет понять многие грозные последствия COVID-19, которые получили название «постковидный синдром» (это и энцефалит, и «мозговой туман», и депрессия). На родине SARS-CoV-2, в Китае, умение вируса персистировать в самых разных системах организма уже учитывают при разработке санитарных мер. Например, при диагностике не только проверяют мазки из дыхательных путей, но и проводят анализ кала.
Стремительные и не совсем ожидаемые мутации коронавируса, его способность поражать самые разные органы и системы человеческого тела, практически абсолютная непредсказуемость — все это породило целый комплекс домыслов, которые социальные психологи уже назвали инфодемией. Но одна конспирологическая теория удостоилась обсуждения в самой квалифицированной профессиональной среде. Не создан ли этот вирус искусственно какой-нибудь дьявольской группой молекулярных генетиков?
Об этом канал «Наука» рассказывает во второй части проекта «Неизвестный ковид». Данный материал составлен на основе сценария этого фильма.
Уход от иммунитета
Причина любых изменений вируса — это всегда мутации. Какие-то из них влияют на распространение вируса, другие — на патогенез вызываемого им заболевания. У B.1.617.2 выделяют около 30 характерных мутаций, сочетание которых и позволяет причислить выделенный вирус к этой линии. Влияние некоторых из них известно, роль других еще только предстоит определить.
Больше всего данных есть по мутациям спайк-белка — именно на нем «завязана» способность коронавируса заражать клетки. Тримеры спайк-белка формируют одинаковые шипы, которыми она плотно покрыта. Шипы цепляются за клеточные рецепторы ACE2, после чего происходит еще несколько реакций, в результате которых вирус сливает свою мембрану с клеточной и содержимое частицы попадает внутрь.
Именно спайк-белок узнает большая часть эффективных антител, способных останавливать распространение SARS-CoV-2 в организме. Таким образом, изменяя спайк-белок, вирус может не только улучшить свою способность связываться с клеточными рецепторами, но и становиться невидимым для некоторых — или даже для всех — антител, выработанных на его предыдущие версии.
На молекулярном уровне это означает, что некоторые аминокислоты (элементарные составляющие белков) в спайк-белке дельта-штамма поменялись на другие или даже вовсе выпали, и в результате поверхность самых «видимых» для антител мест спайк-белка изменилась. Часть антител, которые раньше узнавали какой-то характерный рельеф этой поверхности, стали бесполезны, так как теперь такого рельефа в спайк-белке дельта-штамма нет. Чем меньше антител узнают важные фрагменты спайк-белка, тем больше вирусных частиц, попавших в организм, смогут заражать новые клетки, не встречая сопротивления.
В лаборатории способность сыворотки крови останавливать распространение вируса определяют при помощи реакции нейтрализации. В ходе этой реакции восприимчивые к коронавирусу клетки заражают самим патогенным вирусом или его аналогом (так называемым псевдовирусом, который не вызывает болезнь, но на поверхности несет те же белки, что и коронавирус, и точно так же ведет себя при заражении), параллельно добавляя в культуральную среду разбавленную сыворотку переболевших или вакцинированных. Чем в большее количество раз можно разбавить сыворотку до момента, когда она престанет предотвращать заражение новых клеток, тем эффективнее реакция нейтрализации.
В одной из многочисленных работ антитела из сыворотки людей, переболевших полгода назад, нейтрализовали вариант B.1.617.2 в 4-6 раз хуже, чем B.1.1.7, то есть альфа-штамм. Сыворотка тех, кто переболел больше года назад, справлялась с дельтой еще хуже: в этой когорте людей было много пациентов, чьи антитела в принципе не могли остановить дельта-вариант.
Однако две дозы мРНК-вакцины от Pfizer/BioNTech или векторной от AstraZeneca поднимали уровень нейтрализации до приличного у всех, кто был в исследуемой группе.
Вакцинация помогает поднять уровень эффективных антител, и, хотя часть из них не работают против дельта-штамма, оставшиеся могут побороть его количеством.
Результаты, полученные в лаборатории на культурах клеток, нельзя напрямую транслировать на реальную жизнь, однако приведенные выше данные вполне убедительно показывают, что антитела после заражения предыдущими версиями коронавируса справляются с дельтой весьма посредственно, и чем больше времени прошло с момента болезни, тем хуже защита.
Мутации в генах других белков дельта-штамма изучены намного хуже. Тем не менее, именно они, видимо, отвечают за возможный более тяжелый патогенез болезни, вызываемый этим штаммом. Кроме того, изменения в генах, кодирующих полимеразу, фермент, копирующий вирусный геном, и ее вспомогательные белки, могли обеспечить «индийцу» его сверхвысокую скорость размножения. Вероятно, в недалеком будущем мы увидим работы, проясняющие этот вопрос.
Спутник V против индийского штамма
По заявлению гл. Ц-а “Вектор” Роспотребнадзора Р. Максютова, в России более 95% случаев коронавируса — это Delta. И уже секвенировано около двух десятков тыс. штаммов. Поэтому возникла необходимость в усилении вакцины. По мнению Гинцбурга, перспективным в этом плане было бы использование в качестве бустера 1-го компонента Спутника V.
В итоге сотрудники Ц-а им. Гамалеи объявили, что уже модифицировали Спутник V с учетом штамма Delta. Но о степени ее эффективности пока судить сложно.
Ранее глава Минздрава М. Мурашко сообщал, что эффективность Спутника V в отношении индийской вариации КОВИД-19 составляет 83%. От тяжелых симптомов эта вакцина обеспечивает защиту более чем на 95%. По заявлению РФПИ, эти показатели выше, чем у Pfizer.