Происхождение омикрона
Для того чтобы понять происхождение конкретного штамма, ученые проводят генетический анализ вируса и строят филогенетические деревья. Так они видят, например, из какого региона попал к ним этот вирус. Затем, по мере отбора новых образцов вируса ученые прослеживают дальнейшие его мутации, которые в конечном итоге позволяют патогену «оформиться» в новый штамм с качественно другими свойствами и характеристиками.
Рисунок 1. Омикрон стремительно распространился по всему миру. Новый штамм коронавируса очень заразный — во всех странах побиты рекорды по количеству заболевших за сутки. Изображение: 3d_generator / Depositphotos
Изучая последовательность генома омикрона, ученые подметили одну интересную особенность. Они нашли в нем много общего со штаммом, который циркулировал еще в середине 2020 года. При этом у омикрона почти нет следов от штаммов, циркулирующих в более позднее время, что странно.
Учитывая генетический анализ штамма омикрон, ученые выдвигают 3 теории относительно его происхождения.
1. Источник штамма — животное
Возможно, что в середине 2020 коронавирусом заболели некие животные. В течение года-полтора вирус мутировал в этой популяции, а затем — вновь вернулся к человеку. Сильная сторона этой гипотезы — она объясняет близкое родство омикрона со штаммами середины 2020 года. Слабые стороны этой версии — отсутствие следов животного генома в вирусном генетическом материале. При этом в омикрон» имеются вставки человеческой РНК, что косвенно указывает на его эволюцию именно в организме человека.
2. Распространение вируса в неконтролируемом регионе
Вторая версия происхождения омикрона основана на эволюции вируса в регионе с плохим эпиднадзором. Действительно, в большинстве стран Африки отмечается нехватка как оборудования, так и специалистов для эффективного отслеживания мутаций вируса.
Критики этой теории уверяют, что промежуточные варианты вируса (перед омикроном) не остались бы незамеченными в любой точке мира. Однако мы не знаем, какие именно характеристики приобретали промежуточные формы. Возможно, вирус постепенно накапливал мутации и дойдя до определенной точки, стал стремительно распространяться.
3. Эволюция вируса у людей с иммунодефицитом
Эта самая реалистичная теория, учитывая и регион происхождения нового штамма. Исследователи предполагают, что коронавирус эволюционировал в организме человека с ослабленной иммунной системой. Не исключено, что это был ВИЧ-инфицированный. Иммунная система таких людей плохо справляется с вирусами. Защитных сил могло быть достаточно, чтобы защитить человека от смерти, но не уничтожить вирус. Таким образом, патоген, вероятно, долгое время персистировал в организме и с каждой репликацией (размножением) приобретал новые мутации.
Учитывая тот факт, что в ЮАР ВИЧ-инфекцией заражено более 15% населения, такой сценарий кажется реалистичным.
Источники
- Torjesen I. Covid-19: Omicron may be more transmissible than other variants and partly resistant to existing vaccines, scientists fear. BMJ. 2021 Nov 29;375:n2943. doi: 10.1136/bmj.n2943. PMID: 34845008.
- HKUMed finds Omicron SARS-CoV-2 can infect faster and better than Delta in human bronchus but with less severe infection in lung. https://www.med.hku.hk/en/news/press/20211215-omicron-sars-cov-2-infection
- Официальный твиттер ВОЗ. https://twitter.com/i/broadcasts/1BdGYwkDymLxX?ref_src=twsrc%5Etfw%7Ctwcamp%5Etweetembed%7Ctwterm%5E1481292795914559492%7Ctwgr%5E%7Ctwcon%5Es1_&ref_url=https%3A%2F%2Fnv.ua%2Fworld%2Fcountries%2Fkoronavirus-izmenilsya-podrobnosti-ot-voz-poslednie-novosti-50208229.html
- Omicron and cold-like symptoms rapidly taking over in London. https://covid.joinzoe.com/post/omicron-and-cold-like-symptoms-rapidly-taking-over-in-london
- Попова допустила шестизначные числа заражений COVID из-за «омикрона» https://www.rbc.ru/society/11/01/2022/61dd8bd19a7947ba4bee93b5
- SARS-CoV-2 Omicron-B.1.1.529 Variant leads to less severe disease than Pango B and Delta variants strains in a mouse model of severe COVID-19. Eleanor G. Bentley, Adam Kirby, Parul Sharma, Anja Kipar, Daniele F. Mega, Chloe Bramwell, Rebekah Penrice-Randal, Tessa Prince, Jonathan C. Brown, Jie Zhou, Gavin R. Screaton, Wendy S. Barclay, Andrew Owen, Julian A. Hiscox, James P. Stewart. BioRxiv 2021.12.26.474085; doi: https://doi.org/10.1101/2021.12.26.474085
- WHO says omicron cases are ‘off the charts’ as global infections set new records. CNBC. https://www.cnbc.com/2022/01/12/who-says-omicron-cases-are-off-the-charts-as-global-infections-set-new-records.html
- Lu L, Mok BW, Chen LL, Chan JM, Tsang OT, Lam BH, Chuang VW, Chu AW, Chan WM, Ip JD, Chan BP, Zhang R, Yip CC, Cheng VC, Chan KH, Jin DY, Hung IF, Yuen KY, Chen H, To KK. Neutralization of SARS-CoV-2 Omicron variant by sera from BNT162b2 or Coronavac vaccine recipients. Clin Infect Dis. 2021 Dec 16:ciab1041. doi: 10.1093/cid/ciab1041. Epub ahead of print. PMID: 34915551; PMCID: PMC8754807.
- Lapa D, Grousova DM, Matusali G, Meschi S, Colavita F, Bettini A, Gramigna G, Francalancia M, Garbuglia AR, Girardi E, Puro V, Antinori A, Kovyrshina AV, Dolzhikova IV, Shcheblyakov DV, Tukhvatulin AI, Zubkova OV, Logunov DY, Naroditsky BS, Vaia F, Gintsburg AL. Retention of Neutralizing response against SARS-CoV-2 Omicron variant in Sputnik V vaccinated individuals. MedRxiv. 2022 Jan 20. doi: https://doi.org/10.1101/2022.01.15.22269335
Характерные симптомы и лечение
— У омикрона специфические симптомы, отличные от предыдущих штаммов?
— Симптомы немного варьировали и у предыдущих вариантов. Но в целом у омикрона более легкие симптомы.
— Какие симптомы наиболее характерны?
— Обычно это боль в горле, насморк, мышечная боль, кашель. Заметно реже бывает высокая температура.
— Потеря вкуса и обоняния при заражении омикроном не происходит?
— Нет, это не характерный симптом для омикрона. Он уже и при дельте встречался реже.
— Какой должен быть порядок действий при заражении? Если человек почувствовал симптомы, как ему быть?
— Порядок действия один и тот же. Когда человек чувствует боль в горле, недомогание, боль в мышцах — надо изолироваться, желательно сделать быстрый тест, чтобы понять, коронавирус это или нет.
При омикроне человек остается заразным дольше. В некоторых исследованиях показано, что даже на седьмой день после появления симптомов у многих антиген-тест дает положительный результат, это значит, что человек заразен. Поэтому если вы подозреваете, что заразились коронавирусом, то надо сидеть дома и не контактировать с окружающими минимум дней десять, чтобы точно никого не заразить.
Необходимость во врачебной помощи возникает только при появлении одышки и затрудненности дыхания.
Все остальное: высокая температура, ломота в мышцах, плохое самочувствие, но не дыхательная недостаточность, — не является признаками тяжелого течения и не требует вмешательства врача.
Может ли маска защитить от заражения омикроном
— На фоне того, что омикрон очень заразен, ношение маски теряет смысл или все-таки ее надо носить?
— Ношение маски никогда не теряет смысл.
Омикрон более заразный, поэтому маски, наоборот, являются той мерой, которую надо использовать шире.
В случае дельты человек, пообщавшийся с зараженным пять-десять минут без маски, мог не заразиться. В случае омикрона вероятность того, что заражение произойдет, гораздо выше. Маска это предотвращает. Поэтому ношение ее сейчас имеет еще больше смысла, чем раньше.
— Какие маски лучше защищают?
— Возможные варианты для обычных граждан, по мере убывания защиты:
- Маски FFP2 (в России более представлен аналогичный стандарт KN95). Они дают максимальную степень защиты.
- Медицинские маски.
- Обычные тканевые маски. Относительно них вообще сложно сказать, какую защиту они дают, потому что они очень разные.
Переболевшие дельтой тоже могут заразиться
— Те, кто переболел дельтой, могут заразиться омикроном?
— Да, люди, переболевшие дельтой, могут заразиться омикроном. А переболевшие омикроном могут заразиться дельтой. Вероятность этого довольно высокая, хотя и ниже, чем у невакцинированных и у непереболевших.
Другой вопрос, что дельты скоро не останется, потому что омикрон ее вытеснит. Но тем не менее, если появится какой-то другой штамм, омикрон, вполне вероятно, не даст гарантии, что мы им не заразимся.
— Правда ли, что при омикроне болезнь протекает в более легкой форме?
— В целом мы видим, что болезнь протекает в более легкой форме. Но, в первую очередь, это связано с тем, что мы говорим о людях, которые вакцинированы, переболели, или и вакцинированы, и переболели. И легкая форма болезни, скорее всего, связана с тем, что у них есть Т-клетки, которые менее чувствительны к мутациям, они выработались на вакцину или на заболевание другими штаммами, но они также активны в отношении омикрона.
Относительно собственной патогенности омикрона пока нет достаточного количества данных, потому что людей, которые еще не имеют Т-клеток к коронавирусу, не так много. По предварительным данным, она примерно на 25% ниже, чем была у предыдущих штаммов.
— Омикрон менее опасен, чем другие штаммы коронавируса?
— Для людей с Т-клетками против других вариантов SARS-CoV-2 омикрон действительно менее опасен, и при заражении этим штаммом у них меньше риск попасть в больницу. Но это не значит, что он совсем безопасен. Для пожилых людей, людей с хроническими заболеваниями при заражении омикроном по-прежнему сохраняется риск попасть в больницу и умереть, как и при других штаммах.
Вероятность заражения
Результаты нового исследования количественно , как различные факторы, влияющие на передачу, изменяют ваш риск заболеть: вирусные факторы (возможность передачи инфекции), человеческий фактор (в маске/без маски), физические упражнения/отдых, пение/молчание). Также необходимо учесть ваше местонахождение – помещении/на улице, в большой комнате/в маленькой комнате и прочее.
Тщательно изучив данные о том, сколько людей заразилось во время описанных выше событий и ключевых параметров, таких как размер помещения и уровень вентиляции, исследователи смогли создать математическую модель и вычислить процентную вероятность заражения в различных ситуациях.
Омикрон все больше становится похож на грипп и ОРВИ
Таблица, показывает риск заражения COVID-19, в зависимости от различных факторов. Авторы научной работы также предоставили верный способ подхватить COVID-19 – выполнить следующую комбинацию действий, например: собраться вместе с большим количеством людей в закрытом плохо проветриваемом помещении, например, в спортзале, ночном клубе или школьном классе.
Так что если вам необходимо встретиться с людьми, делайте это на открытом воздухе или в хорошо проветриваемом помещении. Ученые советуют сократить контакты, носить СИЗ, соблюдать дистанцию, мыть руки и, конечно, сделать прививку, так как она снижает шансы заражения и тяжелого течения болезни. Будьте здоровы, берегите себя и близких, в интересное время живем, согласны?
Омикрон — что это и что о нем известно
Впервые о новом штамме заговорили в Южно-Африканской Республике в конце ноября 2021 года. Врачи заметили необычайно высокий всплеск заражений, что могло указывать на появление нового, более заразного варианта коронавируса. После проведения исследований (секвенирование генома) было обнаружено, что у вируса слишком много мутаций. Только на спайк-белок их приходится свыше 30¹. Специалисты Всемирной организации здравоохранения присвоили штамму название «Омикрон» и отнесли его к группе вариантов коронавируса, вызывающих озабоченность.
Основные симптомы штамма омикрон
«Штамм вируса омикрон очень опасен, так как его отличает высокая контагиозность (заразность). Среди основных симптомов заболевания — ломота в теле, головная боль, заложенность носа, насморк и кашель. Этот штамм, в отличие от дельты, реже приводит к пневмонии, но зато чаще вызывает сильный бронхит, с чем и связан сильный кашель. Омикрон реже вызывает и цитокиновый шторм (очень активная работа иммунной системы, когда организм как бы атакует сам себя), за счет того, что инкубационный период у этого вируса намного меньше (3-5 дней). Схема лечения коронавируса с приходом штамма омикрон не поменялась. Для лечения мы предлагаем те же жаропонижающие, обильное питье, симптоматическую терапию».
Сибирский Владимир Юрьевич
эксперт
Врач-кардиолог, заведующий амбулаторно-поликлиническим отделением в Европейском Медицинском Центре
Главная особенность штамма омикрон — чрезвычайно высокая контагиозность. Он стремительно распространяется и размножается в 70 раз быстрее штамма дельта². Это обнаружили ученые из Гонконга. При этом омикрон-штамм, по сравнению с другими вариантами коронавируса, гораздо хуже проникает глубоко, в нижние отделы дыхательных путей. Это дает ученым основания предполагать, что омикрон менее опасен для человека, ведь основная причина госпитализаций — поражение нижних отделов легких.
Стелс-омикрон. Ожидать ли новой волны эпидемии COVID-19?
Грозит ли нам очередная волна пандемии, насколько опасен новый штамм стелс-омикрон, тяжело ли он переносится, а также о действенных способах профилактики — рассказывает профессор Оксана Анатольевна Гизингер.
Читать статью
Волна, вызванная омикроном, — предвестник конца пандемии?
Вирусы, как и остальные существа на Земле, эволюционируют. Однако делают они это куда быстрее человека. А все потому, что если для человека поколение — это два десятка лет, то для вирусов и бактерий — это минуты или секунды.
С каждым новым поколением вирусы накапливают мутации. Некоторые из них позволяют вирусу лучше адаптироваться к хозяину. Характеристики штамма омикрон показывают, что, скорее всего, коронавирус пошел по пути увеличения заразности, но при этом стал менее опасен для человека. В январе 2022 года в мире регистрируют небывалый всплеск заражений — свыше 3,5 миллионов случае ежедневно, чего не было никогда. При этом количество летальных исходов уменьшается.
Пока сложно сказать, действительно ли вирус стал менее опасным. В первую очередь это связано с высоким уровнем вакцинации. Но в ВОЗ уже говорят, что коронавирус постепенно превращается в эндемичную инфекцию (заболевание, привязанное к определенное местности). Другими словами, все идет к тому, что проблема коронавируса перестанет носить пандемический характер, а станет эпидемией, возникающей в том или ином регионе в разное время (например, как с гриппом). При этом эксперты ВОЗ предупреждают, что из-за высокого числа заражений есть угроза коллапса системы здравоохранения в ряде стран. Возможно, омикрон действительно менее опасен, но стремительное его распространение приводит к увеличению количества госпитализаций².
Как передается Омикрон?
Воздух состоит из невидимых, быстро и беспорядочно движущихся молекул, которые со временем рассеиваются в помещении, например, в комнате или автобусе.
Инфицированный человек может выдыхать частицы, содержащие вирус, и чем ближе вы к нему находитесь, тем больше вероятность того, что вдохнете некоторые частицы, содержащие вирус. А еще, чем дольше вы будете находиться в помещении, тем больше распространится вирус. В открытом пространстве Омикрон не накапливается таким же образом.
Конец пандемии, увы, не маячит на горизонте
Ну а теперь держитесь – вирусные частицы могут выделяться при дыхании. И чем глубже вдыхает и выдыхает зараженный, тем больше он распространяет вирусных частиц. В то время как защитная маска уменьшает передачу инфекции, блокируя высвобождение вируса, у инфицированного человека без маски гораздо меньше шансов заразить вас, чем у того, кто спокойно сидит в углу комнаты.
Несмотря на то, что все варианты SARS-CoV-2 одинаково передаются воздушно-капельным путем, вероятность заражения Омикроном зависит от способа передачи (Дельта более заразен, чем предыдущие варианты, а Омикрон его превосходит) и от того, сколько людей сегодня заражено. И несмотря на относительно легкие симптомы, показатели заболеваемости сегодня выше, чем когда-либо, а уровень госпитализации стремительно возрастает.
В чем отличие омикрона
— Чем омикрон отличается от всех предыдущих штаммов коронавируса?
— Главная особенность штамма омикрон в том, что у него очень много изменений по сравнению с другими вариантами одновременно. Ни у одного из предыдущих штаммов такого количества мутаций, появившихся как бы в один момент, не было.
— Он более заразен, чем другие штаммы?
— Ответ на этот вопрос — и да, и нет.
То, что мы видим сейчас — это заразность в популяции, в которой омикрон ушел от антител. Что касается собственной его заразности, то есть заразности в наивной популяции, у которой нет антител, мы не можем сказать, заразнее он, например, штамма альфа или дельта или нет.
Но относительная заразность его выше, потому что дельта, который был господствующим штаммом до прихода омикрона, уже не может заражать вакцинированных и переболевших людей, а омикрон может. Именно поэтому мы видим, что он стремительно распространяется.
Наивная популяция — популяция, которая не сталкивалась с инфекцией.
— Дети чаще стали болеть с появлением омикрона?
— Да, количество детей с COVID-19 в больницах и реанимациях выросло. Пока точно неизвестно, с чем это связано — с тем, что дети более чувствительны к омикрону или они стремительно заражаются просто потому, что этот штамм быстро распространяется.
Много вопросов
Способность к распространению стала визитной карточкой Омикрона, однако причина, по которой этот вариант настолько заразен, была неизвестна. Теперь же исследователи поняли в чем дело: согласно полученным данным, у многих зараженных не проявляется вообще никаких симптомов и они гораздо чаще заражают окружающих.
Из-за бессимптомного течения выявить инфицированных крайне затруднительно, но ученым известно, что можно сделать для самозащиты: носить маску; мыть руки; избегать больших собраний в помещении; и как можно скорее пройти полную вакцинацию. Кажется, ничего нового, но определить как вакцинация влияет на бессимптомных носителей исследователи пока не могут.
Только корь превосходит Омикрон по количеству зараженных
SARS-CoV-2, вирус, вызывающий COVID-19, распространяется в основном воздушно-капельным путем. Таким образом, ключом к предотвращению передачи инфекции является понимание того, как ведут себя частицы, находящиеся в воздухе – а эта задача требует знаний физики и химии.
Омикронная волна в Европе и России
— Европу уже накрыла волна омикрона. Как там сейчас обстоит ситуация и какие меры принимаются?
— Европа большая, в разных странах дела обстоят по-разному. Например, Англия уже преодолела пик заболеваемости, во многих других странах эксперты ожидают его в конце января.
Мы видим, что очень много людей заболевает, ситуация в больницах напряженная.
Это связано с тем, что омикрон за счет ухода от значительной части антител очень заразен, в результате в больницы попадает много людей даже при меньшей относительной патогенности.
В целом европейские страны справляются лучше России, стараются обойтись без значительного ужесточения мер, во-первых, потому что существенная часть населения там привита, многие в том числе и бустерной дозой, во-вторых, в Европе все носят маски и респираторы, что позволяет избежать заражения в общественных местах, в транспорте. Наконец, в-третьих, много где активно используют антиген-тесты для быстрого выявления заразных.
— Какие прогнозы можно дать по развитию ситуации с омикроном в России?
— Думаю, ситуация будет развиваться как обычно. Много людей заболеет, много людей умрет, но серьезные меры вводиться не будут.
Сейчас уже стало очевидно, что огромное количество смертей от коронавируса в России меньше волнует население, чем введение QR-кодов и ограничительных мер — и все это на фоне катастрофически низкого уровня вакцинации.
— Есть мнение, что пандемия закончится на омикроне, ковид наконец станет сезонным заболеванием, как грипп. Такое может произойти?
— Ковид безусловно превратится в некое сезонное заболевание. Очевидно, что мы уже переходим к этой фазе. Остановится ли пандемия на омикроне или это будет какой-то новый штамм, который может появиться, например, где-то в Африке или Южной Америке, сейчас никто не может сказать. Но очевидно, что из пандемической фазы мы переходим в эндемическую.
Вопрос только в том, какой ценой это произойдет. Если люди будут вакцинироваться, получать бустер, чтобы сейчас снизить передачу омикрона, носить маски, то жертв будет меньше. В ином случае мы перейдем к эндемической фазе, лишившись еще десятков или даже сотен тысяч людей.
Пандемия — сильная эпидемия, распространившаяся на территории ряда стран, континентов. Эндемическая фаза — когда заболевание постоянно присутствует в популяции, но не вызывает экстремально больших волн.
— Каких мер надо придерживаться каждому, чтобы сдержать очередную ковидную волну?
— Вакцинация, ношение масок и респираторов, вентиляция помещений, ограничение многолюдных сборищ и регулярное антиген-тестирование позволят снизить пик омикронной волны и уменьшить нагрузку на систему здравоохранения.
Фото: freepik.com
Вакцина и омикрон
— Вакцина не предотвращает заражение омикроном?
— Привитые двумя дозами могут заразиться, три дозы вакцины от коронавируса дают хорошую защиту от заражения омикроном, по крайней мере в первые несколько месяцев.
— Вакцина позволяет снизить риск госпитализаций и тяжелого течения при омикроне?
— Тяжелое течение может предотвратить даже вакцинация двумя дозами.
— Омикрон может быть «живой вакциной» или переболевшие потом могут продолжить заражаться другими штаммами коронавируса?
— Идея, что коронавирус, про который известно, что он наносит существенный вред здоровью и убивает людей, можно использовать как вакцину — несколько безумна.
Вирус с такой летальностью, как у коронавируса, не может быть живой вакциной.
При этом сейчас есть возможность прививаться безопасной вакциной, чтобы избежать заражения, риска получить тяжелые симптомы, пожизненные осложнения в виде лонг-ковида и смерти, и помогать вирусу распространяться по популяции в таких условиях — верх безответственности и цинизма.
Чем опасен омикрон
Основная опасность омикрона — в его высокой заразности, из-за чего может увеличиться смертность. При этом, как показывают предварительные данные, летальность при заражении новым штаммом снизилась в 4-17 раз.
Смертность и летальность: в чем разница?
Важнейшими показателями для оценки опасности той или иной инфекции являются смертность и летальность. В СМИ часто путают эти два понятия, полагая, что это синонимы, чем вводят людей в заблуждение. Когда говорят о летальности, то подразумевают процент умерших от числа заболевших. Например, если в стране заболела 1000 человек, а умерло 20, то летальность составит 2%. Смертность — это число смертей по стране, что выражается в количестве умерших на миллион (или другую единицу) населения. Например, если в России от коронавирусной инфекции умерло 700 человек, то смертность в этот день составит 700/146=4,8 чел/млн.
Снижение летальности — это действительно хорошая новость, которая позволяет с оптимизмом смотреть в будущее. Однако чрезвычайно высокая заразность в абсолютных цифрах может привести к еще большему числу госпитализаций и смертей. Так, если раньше в США в пиковые периоды регистрировали 100-250 тыс. заражений в сутки, то в середине января 2022 года этот показатель доходит до миллиона (10 января в США был абсолютный рекорд — 1 398 242 заболевших). До омикрона во Франции суточный максимум по заражениям составлял 60-80 тыс., а теперь это более 300 тыс. Стремительно увеличиваются показатели и в России. Глава Роспотребнадзора Анна Попова допускает, что число заражений по стране может превысить 100 тыс в сутки⁵.
Штамм омикрон более заразный, чем дельта, но, по предварительным данным, менее опасный. Однако из-за большого количества заболевших растет и число госпитализаций. Фото: MrDm / freepik.com
Профессор вирусологии, главный научный сотрудник НИЦ эпидемиологии и микробиологии им. Гамалеи Анатолий Альтштейн полагает, что летальность от штамма омикрон в России будет в пределах 0,5%, а в странах с более высоким уровнем вакцинации — 0,1-0,2%.
Как и прежде, новый штамм считается более опасным для пожилых людей, а также лиц с ожирением, гипертонией и другими хроническими заболеваниями.