Какие еще есть штаммы COVID-19
Перечисленные выше мутации вируса SARS-CoV-2 уже заразили сотни тысяч людей по планете. Какие штаммы коронавируса еще ждать после этого? Штаммы, вызывающие интерес ВОЗ, но о которых пока нет конкретных данных:
- Тета «филиппинский» штамм (зафиксирован в январе 2021 года)
- Йота «американский» штамм (появился в ноябре 2020 года). Подробнее об американском штамме ковида в нашей статье «Йота штамм коронавируса«.
Пока омикрон является последним зафиксированным штаммом коронавируса. Но можно встретить сообщения о появлении комбинированных вариантов.
Дельтакрон штамм
Сообщение о том, что два штамма объединились в новый и образовали «Дельтакрон» на Кипре подвергли сомнению. Как сообщают РИА новости, слишком мала вероятность того, что омикрон и дельта образовали гибрид и новый штамм. Вероятнее всего, это была лабораторная ошибка, когда вирусы были случайно смешаны между собой. Этой же версии придерживается и глава Роспотребнадзора К. Хафизов.
Российский штамм
В феврале 2021 года в России зафиксирован первый случай заражения. Уже к концу лета российским штаммом коронавируса заразилось свыше 300 человек. ВОЗ зарегистрировала его как AT.1. и добавила в список для дальнейшего наблюдения. Но уже через некоторое время исключила из-за недостаточности данных об опасности.
Происхождение омикрона
Для того чтобы понять происхождение конкретного штамма, ученые проводят генетический анализ вируса и строят филогенетические деревья. Так они видят, например, из какого региона попал к ним этот вирус. Затем, по мере отбора новых образцов вируса ученые прослеживают дальнейшие его мутации, которые в конечном итоге позволяют патогену «оформиться» в новый штамм с качественно другими свойствами и характеристиками.
Рисунок 1. Омикрон стремительно распространился по всему миру. Новый штамм коронавируса очень заразный — во всех странах побиты рекорды по количеству заболевших за сутки. Изображение: 3d_generator / Depositphotos
Изучая последовательность генома омикрона, ученые подметили одну интересную особенность. Они нашли в нем много общего со штаммом, который циркулировал еще в середине 2020 года. При этом у омикрона почти нет следов от штаммов, циркулирующих в более позднее время, что странно.
Учитывая генетический анализ штамма омикрон, ученые выдвигают 3 теории относительно его происхождения.
1. Источник штамма — животное
Возможно, что в середине 2020 коронавирусом заболели некие животные. В течение года-полтора вирус мутировал в этой популяции, а затем — вновь вернулся к человеку. Сильная сторона этой гипотезы — она объясняет близкое родство омикрона со штаммами середины 2020 года. Слабые стороны этой версии — отсутствие следов животного генома в вирусном генетическом материале. При этом в омикрон» имеются вставки человеческой РНК, что косвенно указывает на его эволюцию именно в организме человека.
2. Распространение вируса в неконтролируемом регионе
Вторая версия происхождения омикрона основана на эволюции вируса в регионе с плохим эпиднадзором. Действительно, в большинстве стран Африки отмечается нехватка как оборудования, так и специалистов для эффективного отслеживания мутаций вируса.
Критики этой теории уверяют, что промежуточные варианты вируса (перед омикроном) не остались бы незамеченными в любой точке мира. Однако мы не знаем, какие именно характеристики приобретали промежуточные формы. Возможно, вирус постепенно накапливал мутации и дойдя до определенной точки, стал стремительно распространяться.
3. Эволюция вируса у людей с иммунодефицитом
Эта самая реалистичная теория, учитывая и регион происхождения нового штамма. Исследователи предполагают, что коронавирус эволюционировал в организме человека с ослабленной иммунной системой. Не исключено, что это был ВИЧ-инфицированный. Иммунная система таких людей плохо справляется с вирусами. Защитных сил могло быть достаточно, чтобы защитить человека от смерти, но не уничтожить вирус. Таким образом, патоген, вероятно, долгое время персистировал в организме и с каждой репликацией (размножением) приобретал новые мутации.
Учитывая тот факт, что в ЮАР ВИЧ-инфекцией заражено более 15% населения, такой сценарий кажется реалистичным.
Когда ожидается новая волна коронавируса в России в 2021 2022 году — последние новости
Штамм «омикрон» может вызвать в России новую волну заболеваемости коронавирусом, которая будет сильнее, чем при «дельте». Соответствующее заявление сделал иммунолог Николай Крючков.
По его словам, новый штамм может вызвать и рост смертности, особенно среди непривитых граждан.
Крючков подчеркнул, что «омикрон» появился в странах, где низкий процент вакцинации населения.
Он подверг жесткой критике заявления антиваксеров о том, что «омикрон» возник из-за адаптации вируса к вакцинам. Все было как раз наоборот — вирус мутировал из-за адаптации к специфическому иммунитету после заболевания.
Напомним, Всемирная организация здравоохранения пока не располагает данными, на основании которых можно было бы утверждать, что новый омикрон-штамм коронавируса заразнее других штаммов.
По сообщениям ВОЗ, число заражений коронавирусом в ЮАР выросло в районах, затронутых этим штаммом, но пока непонятно точно, связано ли это с «омикроном» или же с другими факторами.
В ЮАР ученые круглосуточно исследуют новый штамм коронавируса, республика предпринимает все возможные меры для борьбы с ним. В России «омикрон»-штамм пока не обнаружен, заявили в Роспотребнадзоре.
Эффективность вакцин против штаммов COVID-19
Ученые заявляют, что существующие сейчас препараты для вакцинации от SARS-CoV-2 могут и дальше с успехом использоваться для защиты населения от всех вариаций и мутаций коронавируса. Особая надежда на третью бустерную вакцину, которую необходимо сделать через полгода после повторной ревакцинации. Она будет действовать на штаммы коронавируса 2022.
Вариаций и разновидностей коронавируса сейчас очень много, особо сильных и опасных всего шесть. При появлении характерных симптомов не нужно заниматься самолечением. Первое, что следует сделать, обратиться к врачу. Специалист оценит состояние, при выявлении заболевания с помощью проведенного теста, подберет эффективный протокол лечения.
Дорогой читатель, мы собрали всю самую важную и актуальную информацию о COVID-19 на 1 странице — главное о коронавирусе.Также, доступна актуальная статистика по: России, Москве, Подмосковью и городам, СпБ и всем регионам РФ и странам мира.
Мне нравится7Не нравится1
Источники
- Torjesen I. Covid-19: Omicron may be more transmissible than other variants and partly resistant to existing vaccines, scientists fear. BMJ. 2021 Nov 29;375:n2943. doi: 10.1136/bmj.n2943. PMID: 34845008.
- HKUMed finds Omicron SARS-CoV-2 can infect faster and better than Delta in human bronchus but with less severe infection in lung. https://www.med.hku.hk/en/news/press/20211215-omicron-sars-cov-2-infection
- Официальный твиттер ВОЗ. https://twitter.com/i/broadcasts/1BdGYwkDymLxX?ref_src=twsrc%5Etfw%7Ctwcamp%5Etweetembed%7Ctwterm%5E1481292795914559492%7Ctwgr%5E%7Ctwcon%5Es1_&ref_url=https%3A%2F%2Fnv.ua%2Fworld%2Fcountries%2Fkoronavirus-izmenilsya-podrobnosti-ot-voz-poslednie-novosti-50208229.html
- Omicron and cold-like symptoms rapidly taking over in London. https://covid.joinzoe.com/post/omicron-and-cold-like-symptoms-rapidly-taking-over-in-london
- Попова допустила шестизначные числа заражений COVID из-за «омикрона» https://www.rbc.ru/society/11/01/2022/61dd8bd19a7947ba4bee93b5
- SARS-CoV-2 Omicron-B.1.1.529 Variant leads to less severe disease than Pango B and Delta variants strains in a mouse model of severe COVID-19. Eleanor G. Bentley, Adam Kirby, Parul Sharma, Anja Kipar, Daniele F. Mega, Chloe Bramwell, Rebekah Penrice-Randal, Tessa Prince, Jonathan C. Brown, Jie Zhou, Gavin R. Screaton, Wendy S. Barclay, Andrew Owen, Julian A. Hiscox, James P. Stewart. BioRxiv 2021.12.26.474085; doi: https://doi.org/10.1101/2021.12.26.474085
- WHO says omicron cases are ‘off the charts’ as global infections set new records. CNBC. https://www.cnbc.com/2022/01/12/who-says-omicron-cases-are-off-the-charts-as-global-infections-set-new-records.html
- Lu L, Mok BW, Chen LL, Chan JM, Tsang OT, Lam BH, Chuang VW, Chu AW, Chan WM, Ip JD, Chan BP, Zhang R, Yip CC, Cheng VC, Chan KH, Jin DY, Hung IF, Yuen KY, Chen H, To KK. Neutralization of SARS-CoV-2 Omicron variant by sera from BNT162b2 or Coronavac vaccine recipients. Clin Infect Dis. 2021 Dec 16:ciab1041. doi: 10.1093/cid/ciab1041. Epub ahead of print. PMID: 34915551; PMCID: PMC8754807.
- Lapa D, Grousova DM, Matusali G, Meschi S, Colavita F, Bettini A, Gramigna G, Francalancia M, Garbuglia AR, Girardi E, Puro V, Antinori A, Kovyrshina AV, Dolzhikova IV, Shcheblyakov DV, Tukhvatulin AI, Zubkova OV, Logunov DY, Naroditsky BS, Vaia F, Gintsburg AL. Retention of Neutralizing response against SARS-CoV-2 Omicron variant in Sputnik V vaccinated individuals. MedRxiv. 2022 Jan 20. doi: https://doi.org/10.1101/2022.01.15.22269335
Штаммы, вызывающие интерес ВОЗ
Кроме вариантов, считающихся особенно опасными, есть и другие, к которым ВОЗ относится внимательно, регулярно изучает их характер и проявления. Эти штаммы коронавируса ВОЗ пока носят локальный и ограниченный характер и не отличаются агрессивным действием.
Эпсилон «американский» штамм
Вариант выявлен в июле 2020 года в США, в России случаи не зарегистрированы. Эпсилон имеет модифицированный спайковый белок, поэтому очень быстро приспосабливается и «обходит» иммунные антитела переболевших.
Зета «бразильский» штамм
Вариант P.2 широко распространен в Бразилии. Имеет только одну неприятную мутацию — E484K. Сообщается, что моноклональные и сывороточные антитела в 10-60 раз менее эффективны в нейтрализации вируса, несущего мутацию E484K.
Согласны ли вы с мнением, что пандемия прекратится только когда переболеют 70% людей на Земле?
Да 46.96%
Нет 33.87%
Не хочется в это верить
19.17%
Проголосовало: 10239
Эта штамм
По состоянию на 16 февраля 2021 года был выявлен в 15 странах, первые случаи зафиксированы в январе 2020 году в Нигерии и Великобритании. Профессор Рави Гупта из Кембриджского университета отметил, что штамм имеет значительные мутации, замеченные в некоторых других вариациях. Такие выводы обнадеживают, т.к. вероятный эффект в некоторой степени предсказуем.
Каппа «индийский» штамм
Согласно данным платформы GISAID, доля индийского штамма в России в июне 2021 года превысила 70%. Лидером по числу отобранных образцов является Великобритания (почти 40 тыс.).
Лямбда «перуанский» штамм
В июне 2021 года ВОЗ перевела «Лямбда» (С.37) в категорию «вызывающий интерес». Этот относительно молодой штамм с несколькими опасными мутациями зафиксирован более чем в 30 странах (преимущественно в Северной и Южной Америке).
По предварительным исследованиям, проведенными учеными из Чили, лямбда более заразен, по сравнению с «уханьским» и имеет высокую резистентность к вакцинам.
Мю штамм
ВОЗ внесла “колумбийский” штамм в список вариантов, представляющих интерес. Как следует из реестра на сайте организации ему присвоен идентификатор “мю”.
Согласно исследованию медиков Биомедицинских Университетов Риса и Брешия у пациентов, привитых вакциной Pfizer, имеется хорошая сопротивляемость к мю штамму.
В базе данных GISAID указывается, что впервые штамм был выявлен в январе 2021 года в Колумбии. С того времени в мире зафиксировано свыше 3700 заражений (особенно в странах Латинской и Центральной Америки, и США — более 1,4 тыс. случаев).
Что такое штаммы коронавируса?
Каждый вирус и COVID-19, в том числе, имеет свой уникальный геном. При постоянной репликации и переходе от одного человека к другому, вирус немного изменяется, то есть мутирует. Если геном вируса претерпел одну или более мутаций и уже отличается от «родительского», его называют штаммом.
Эпидемия SARS-CoV2 начатая в 2019 году перешла в пандемию, а изучением и способами терапии мутаций вируса занимаются специалисты всего мира.
SARS-CoV-2 медленно мутирует, хотя и у него насчитывается уже несколько тысяч штаммов. Для упрощения классификации их объединяют в группы — клады, которых всего семь: GR, G, O, S, L, GH, V.
На сайт GISAID (международная платформа и база геномов вируса) которая предложила классификацию штаммов, ученые со всего мира загружают информацию о расшифрованных геномах. Данные о 80% из более 5 млн. геномов SARS-CoV2, занесенные в базу, поступили из Северной Америки и Европы.
Первым штаммом и классическим КОВИД-19 стал коронавирус клада L, который появился в Китае в 2019. Дальнейшие мутации постепенно видоизменили вирус и на начало 2022 года выделяют уже 6 основных штаммов. Все их принято называть буквами греческого алфавита, чтобы не привязываться к стране, где они были выявлены.
Все мутировавшие штаммы коронавируса ВОЗ разделила на подгруппы:
- Опасные для человека, которые дают повод для беспокойства (VOC) — штаммы альфа, бета, гамма, дельта;
- Относительно безопасные, но которые вызывают научный интерес ВОЗ (VOI) — штамм лямбда;
- Прочие мутации SARS-CoV-2.
При этом каждый штамм содержит в себе по несколько мутаций или подвидов.
ВОЗ сообщает, что не все мутации вируса опасны для человека и ведут к смерти. Штаммы отличаются степенью заразности, методом распространения и возможностью перехода в более тяжелые формы. Имеются отличия в реакции отдельных вариантов на иммунитет человека, тест-системы и на вакцины от предыдущих типов КОВИД-19.
Россиянам предрекли конец эпидемии коронавируса из-за омикрон-штамма
Из-за большого количества мутаций в новом штамме коронавируса можно сделать вывод, что он не слишком жизнеспособен, хотя омикрон-вариант пока изучен не до конца, сказал научный сотрудник Национального исследовательского центра эпидемиологии и микробиологии имени Н. Ф. Гамалеи, вирусолог Анатолий Альтштейн в беседе с «Известиями».
«Пока непонятно, насколько он чувствителен к антителам, выявляемым разными вакцинами, и его летальность полностью не изучена. О мерах профилактики я воздержался бы говорить. Я убежден, что даже если он дойдет до России, с его приходом настанет конец эпидемии», — считает ученый.
В 20-х числах ноября ученые сообщили о появлении в Ботсване и ЮАР штамма коронавируса B.1.1.529, который содержит несколько десятков мутаций в S-белке, необходимом патогену для заражения клеток.
По мнению исследователей, многие из новых изменений в геноме SARS-CoV-2 указывают на высокую трансмиссивность этого варианта и устойчивость к защитным антителам переболевших и привитых, хотя окончательные выводы делать пока рано. Специалисты предполагают, что B.1.1.529 изначально развился в организме человека с ослабленным иммунитетом, вероятно, больного СПИД или ВИЧ.
Заключение
Подведем итоги:
- Штамм омикрон — новый вариант коронавируса, обнаруженный в конце ноября 2021 года в Южно-Африканской Республике.
- Омикрон стремительно распространяется по планете, вытесняя остальные штаммы. По прогнозам экспертов ВОЗ, через несколько недель новым штаммом заразится половина населения Европы и Центральной Азии.
- Штамм омикрон, скорее всего, менее опасен для человека. По предварительным данным, летальность при заражении этим вариантом коронавируса ниже в 4-17 раз по сравнению с другими штаммами.
- Некоторые эксперты полагают, что появление омикрона — это предвестник конца пандемии. В ВОЗ сделали оптимистичное заявление о том, что коронавирусная инфекция идет по пути превращения в эндемичное заболевание. Но при этом эксперты призвали не относиться к омикрону легкомысленно.
- Профилактические и лечебные мероприятия в отношении омикрона такие же, как и для других штаммов.
- Существующие вакцины против нового штамма работают хуже. В настоящее время идут работы над модификацией ряда вакцин под вариант омикрон. Ожидается, что модифицированные вакцины появятся весной 2022 года.